中山大學生命科學學院教授李文均課題組聯(lián)合農(nóng)業(yè)農(nóng)村部沼氣科學研究所、中國地質(zhì)大學(武漢)、以色列耶路撒冷希伯來大學、美國內(nèi)華達大學拉斯維加斯分校和加州大學圣地亞哥分校等的研究人員,在放線菌生命暗物質(zhì)的生態(tài)功能與進化研究中取得新進展。相關研究成果近日發(fā)表于《國際微生物生態(tài)學會會刊》。中山大學為該成果第一完成單位。
據(jù)了解,放線菌作為與人類生產(chǎn)和生活極為密切的微生物類群,具有強大的代謝活性。目前對可培養(yǎng)放線菌資源和次級代謝產(chǎn)物等相關領域的研究較多,但對放線菌生命暗物質(zhì)的研究相對匱乏。對于放線菌生命暗物質(zhì)的研究,將為人們打開另一扇放線菌知識的大門,對積累放線菌遺傳信息資源具有重要意義。
研究人員通過宏基因組分箱技術獲得了15個來自熱泉的宏基因組組裝基因組(MAGs),結合公共數(shù)據(jù)庫的27個MAGs,首次依照命名法則對這些MAGs以層級命名的方式命名了放線菌3個未培養(yǎng)新綱。其中,WLP固碳通路在放線菌3個新綱類群的發(fā)現(xiàn),刷新了放線菌功能多樣性的認知;同時,研究人員發(fā)現(xiàn)氫酶和產(chǎn)乙酸相關基因普遍存在于放線菌的3個新綱中,因此推測放線菌門類存在可能的同型產(chǎn)乙酸功能,并通過富集實驗證據(jù)展現(xiàn)了放線菌同型產(chǎn)乙酸功能的可能性。
此外,研究人員通過系統(tǒng)進化分析,表明這種H2依賴的WLP固碳方式不存在于這3個綱的共同祖先,應該屬于后期進化獲得的。
該研究讓研究人員了解到放線菌的奇妙之處不只在其次級代謝產(chǎn)物多樣性上,其在生態(tài)功能和WLP進化歷史中也起著重要作用。對于科研工作者而言,該工作僅是進一步探索放線菌生命暗物質(zhì)生態(tài)功能和進化機制的開始。