近日，中國(guó)農(nóng)科院北京畜牧獸醫(yī)研究所豬遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)繪制出豬胚胎發(fā)育全期骨骼肌基因組染色質(zhì)開放區(qū)域精細(xì)圖譜，鑒定了調(diào)節(jié)肌肉發(fā)育的順式調(diào)控元件及相關(guān)基因，為進(jìn)一步研究豬胚胎骨骼肌發(fā)育相關(guān)基因的調(diào)控動(dòng)力學(xué)奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)成果發(fā)表于《畜牧與生物技術(shù)雜志》。
據(jù)介紹，豬胚胎肌肉發(fā)育主要集中在兩個(gè)生長(zhǎng)波，即胚胎期35天~60天，初級(jí)纖維形成;胚胎期54天~90天，次級(jí)纖維生成。發(fā)育過程中，大量轉(zhuǎn)錄因子通過與開放的靶基因DNA序列結(jié)合調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的發(fā)生，進(jìn)而控制骨骼肌發(fā)育進(jìn)程。但由于豬胚胎期骨骼肌基因組范圍染色質(zhì)開放性尚不清晰，豬經(jīng)濟(jì)性狀分子機(jī)理解析及基因組育種技術(shù)創(chuàng)新受到制約。
為攻克這一問題，研究人員以大白豬為研究對(duì)象，利用ATAC-seq、RNA-seq等多種組學(xué)研究技術(shù)，獲得了包含45、70和100天胚齡時(shí)期骨骼肌表觀遺傳調(diào)控?cái)?shù)據(jù)，并在3個(gè)胚胎時(shí)期分別鑒定出21638、35447和60181個(gè)染色體開放區(qū)域。研究還發(fā)現(xiàn)多個(gè)調(diào)控肌肉發(fā)育相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄因子以及大量轉(zhuǎn)錄阻遏物，為豬功能基因組及性狀調(diào)控機(jī)制研究提供了重要參考。
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