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改造腺嘌呤堿基編輯器擴(kuò)大了堿基編輯器的效用

2021-08-10 10:16:42

韓國漢陽大學(xué)Sangsu Bae、高麗大學(xué)Jae-Sung Woo等研究人員合作發(fā)現(xiàn),腺嘌呤堿基編輯器的改造能夠減少旁觀者胞嘧啶編輯。相關(guān)論文近日在線發(fā)表于《自然—生物技術(shù)》。

研究人員表示,腺嘌呤堿基編輯器(ABE)在感興趣的基因組位點催化特定的A到G 轉(zhuǎn)換。然而,ABE也會在靶點誘導(dǎo)胞嘧啶脫氨。

為了降低胞嘧啶編輯活性,研究人員設(shè)計了一種常用的腺苷脫氨酶TadA7.10,并發(fā)現(xiàn)在TadA7.10中具有D108Q突變的ABE7.10表現(xiàn)出降低了十倍的胞嘧啶脫氨活性。D108Q突變還降低了最近開發(fā)的兩種ABE高活性版本ABE8e和ABE8s中的胞嘧啶脫氨活性,并且與V106W兼容,這是一種減少脫靶RNA編輯的突變。

包含P48R突變的ABE7.10顯示出增加的胞嘧啶脫氨活性和顯著降低的腺嘌呤編輯率,從而產(chǎn)生用于TC到TT或TC到TG轉(zhuǎn)換的TC特異性堿基編輯工具,從而擴(kuò)大了堿基編輯器的效用。

標(biāo)簽: 嘌呤 編輯器 效果 兼容

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