自噬是細(xì)胞自身物質(zhì)更新代謝的重要機(jī)制,簡單地說,就是“自己吃自己”。自噬事關(guān)細(xì)胞從成長、發(fā)育到衰老的全部過程,對(duì)維持機(jī)體健康至關(guān)重要,吸引著科學(xué)家的高度關(guān)注。
自2015年起,在國家自然科學(xué)基金創(chuàng)新研究群體項(xiàng)目“多細(xì)胞生物自噬過程中膜的構(gòu)建與融合”(以下簡稱創(chuàng)新群體項(xiàng)目)支持下,中國科學(xué)院生物物理研究所研究員張宏帶領(lǐng)科研人員對(duì)自噬小體的形成以及自噬小體的成熟機(jī)制進(jìn)行了深入研究,取得豐碩成果。
科研一小步 認(rèn)知一大步
“自己吃自己”的細(xì)胞自噬相當(dāng)于“垃圾回收”的過程,具有雙層膜結(jié)構(gòu)的自噬小體收集細(xì)胞內(nèi)受損的細(xì)胞器和其他垃圾,送給“回收站”溶酶體,并在酸性條件下進(jìn)行降解。當(dāng)細(xì)胞處于包括饑餓在內(nèi)的各種脅迫條件下,自噬又能降解細(xì)胞內(nèi)一些不必要的物質(zhì),為細(xì)胞提供物質(zhì)和能量,幫助細(xì)胞渡過艱難困境。
盡管早在上世紀(jì)60年代科學(xué)家就發(fā)現(xiàn)了細(xì)胞自噬的現(xiàn)象,但其真正為普通人所熟悉還是在2016年。這一年,喜歡喝酒、能寫一手漂亮的毛筆字、須發(fā)皆白的日本科學(xué)家大隅良典獨(dú)享諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。從上世紀(jì)90年代開始,大隅良典選擇酵母為研究自噬的模型,不僅首次在酵母中觀察到自噬現(xiàn)象,還為建立酵母為研究細(xì)胞自噬的遺傳篩選模型奠定了基礎(chǔ)。
很長一段時(shí)間,科學(xué)家對(duì)自噬的理解都是基于單細(xì)胞生物酵母中鑒定的自噬基因的研究。長期從事秀麗線蟲研究的張宏認(rèn)為,多細(xì)胞生物的自噬過程要復(fù)雜得多。“在多細(xì)胞生物中,自噬小體形成時(shí),需與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)建立動(dòng)態(tài)的互作,另外新形成的自噬小體需要先與多種內(nèi)吞體融合,經(jīng)歷‘自噬小體成熟’的過程,最終與溶酶體融合形成有降解活性的自噬溶酶體。”他說。
這一過程一直沒有得到揭示。2015年,在大隅良典獲頒諾貝爾獎(jiǎng)的前一年,國內(nèi)該領(lǐng)域的專家就前瞻性地預(yù)見到多細(xì)胞自噬在科學(xué)上的重大價(jià)值,創(chuàng)新群體項(xiàng)目正是在這樣的背景下立項(xiàng)。
5年來,在國家自然科學(xué)基金的支持下,創(chuàng)新群體項(xiàng)目成員率先推進(jìn)了全球“獨(dú)一份”的研究工作。“我們?cè)谇叭嘶A(chǔ)上走的一小步,卻是多細(xì)胞生物自噬認(rèn)知上的一大步。”張宏說。
張宏課題組建立了線蟲作為研究多細(xì)胞生物自噬的研究模型,在國際上首次通過遺傳篩選鑒定了系列多細(xì)胞生物特有的新自噬基因,并揭示了這些新基因在多細(xì)胞生物自噬特有步驟中發(fā)揮的功能。例如,研究人員發(fā)現(xiàn)定位內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的一個(gè)基因EPG3能夠調(diào)控自噬小體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的相互作用,如果這一基因缺失,則會(huì)阻斷自噬小體正常形成。而EPG5則通過與溶酶體上的多個(gè)蛋白相互作用,在自噬小體成熟過程中扮演著重要角色。
基礎(chǔ)研究的使命與擔(dān)當(dāng)
黨的十九屆五中全會(huì)把科技自立自強(qiáng)作為國家發(fā)展的戰(zhàn)略支撐,提出“面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場、面向國家重大需求、面向人民生命健康”。其中,“面向人民生命健康”是一個(gè)新的方向。
作為生命科學(xué)研究者,群體成員也一直堅(jiān)信,基礎(chǔ)研究要堅(jiān)持面向人民生命健康。2020年初,新冠疫情來勢(shì)洶洶,張宏和團(tuán)隊(duì)成員立刻付諸實(shí)踐。“這是我們項(xiàng)目計(jì)劃以外的一個(gè)課題。”張宏告訴《中國科學(xué)報(bào)》,新冠疫情牽動(dòng)著全中國乃至全球人民的心,作為科學(xué)家,他們更不能置身事外。
抵抗外來入侵的病原體,自噬也是相當(dāng)重要的機(jī)制之一。新冠病毒快速入侵人體的現(xiàn)象引起了群體成員的注意。經(jīng)過篩選,群體成員發(fā)現(xiàn)新冠病毒編碼的ORF3a蛋白能夠抑制自噬小體和溶酶體的融合過程。形象地說,這個(gè)病毒蛋白把一些原本在自噬小體成熟過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用的分子牢牢“拽”著,幫助病毒逃脫被降解的命運(yùn)。研究人員相信,這項(xiàng)研究對(duì)于理解新冠病毒的高傳染性和致病性以及開發(fā)潛在的治療方法有重要意義。
神經(jīng)退行性疾病也是群體成員重點(diǎn)關(guān)注的現(xiàn)實(shí)需求之一。過去的一系列研究顯示,阿爾茨海默病的發(fā)生與淀粉樣蛋白聚集相關(guān)。那么,為什么淀粉樣蛋白不能被自噬清除呢?
“我們看到一個(gè)現(xiàn)象,即使細(xì)胞自噬機(jī)制正常,沒有受到任何損傷,有一些蛋白質(zhì)聚集體仍然無法被清除。”張宏介紹。于是,群體成員獨(dú)辟蹊徑地將目標(biāo)鎖定在蛋白質(zhì)聚集體上。經(jīng)過一系列實(shí)驗(yàn),他們確認(rèn),蛋白質(zhì)本身的物質(zhì)狀態(tài)影響了自噬作用的效果,如呈現(xiàn)出膠狀的蛋白質(zhì)聚集體才能誘導(dǎo)產(chǎn)生雙層膜結(jié)構(gòu)從而進(jìn)入自噬過程被清除掉。而呈現(xiàn)出固體、纖維狀的淀粉樣蛋白則無法誘導(dǎo)形成雙層膜,從而逃避被清除。
基礎(chǔ)研究本身也推動(dòng)人們對(duì)相關(guān)疾病的認(rèn)知。“人類遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),我們利用線蟲遺傳體系篩選得到的EPG5基因突變會(huì)導(dǎo)致一種稱作Vici綜合征的多系統(tǒng)紊亂疾病,但其致病機(jī)制仍不清楚。”該團(tuán)隊(duì)的研究發(fā)現(xiàn)EPG5特異性介導(dǎo)自噬小體與晚期內(nèi)吞體之間的融合。EPG5缺失會(huì)導(dǎo)致無法形成有功能的自噬溶酶體,從而引起細(xì)胞內(nèi)膜系統(tǒng)功能紊亂。這一研究對(duì)闡述Vici綜合征的發(fā)生發(fā)展有重要意義。
群體成員表示,未來,他們將繼續(xù)以細(xì)胞自噬為視角探索重大疾病發(fā)生的機(jī)制、發(fā)現(xiàn)新藥物靶點(diǎn)、開發(fā)新治療方案,為面向人民生命健康作出基礎(chǔ)研究者應(yīng)有的貢獻(xiàn)。
優(yōu)勢(shì)互補(bǔ) 精誠合作
在該創(chuàng)新群體項(xiàng)目中,張宏和胡俊杰、徐平勇、徐濤等4位來自中國科學(xué)院生物物理研究所的研究員優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)、協(xié)同攻關(guān),共同解析細(xì)胞自噬作用。
張宏坦言,回顧創(chuàng)新群體項(xiàng)目申請(qǐng)與執(zhí)行的歷程,正是這一項(xiàng)目為他們提供了合作的契機(jī)和平臺(tái)。“胡俊杰長期從事內(nèi)質(zhì)網(wǎng)方面的研究,多細(xì)胞生物的自噬小體是在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上生成,與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的動(dòng)態(tài)互作也是多細(xì)胞生物特有的過程。”他說。因此,決定申請(qǐng)項(xiàng)目之初,張宏就主動(dòng)邀請(qǐng)剛剛加入中國科學(xué)院生物物理研究所的胡俊杰。
徐濤和徐平勇的強(qiáng)項(xiàng)則在于發(fā)展新技術(shù)新方法研究自噬過程的膜融合。其中,徐濤主攻超高分辨顯微成像技術(shù)以研究自噬蛋白的定位,徐平勇則主攻熒光探針與成像方法。在創(chuàng)新群體項(xiàng)目支持下,他們和群體成員合作發(fā)展出光鏡—電鏡聯(lián)合探針mEosEM和PANL-SIM超分辨成像探針,提高了在活細(xì)胞中觀測(cè)自噬小體的分辨率。
“一項(xiàng)成像技術(shù)從開發(fā)到真正在某一個(gè)生物學(xué)問題上實(shí)現(xiàn)應(yīng)用,可能需要很長時(shí)間的積累,特別是對(duì)于細(xì)胞自噬這一高度動(dòng)態(tài)的過程。”張宏說。
因此,盡管創(chuàng)新群體項(xiàng)目已經(jīng)結(jié)題,幾位群體成員仍在進(jìn)行通力合作,靜待新技術(shù)“開花結(jié)果”。
面向未來,研究人員看好自噬研究的前景。“多細(xì)胞生物自噬研究才剛剛起步,還有許多問題需要科學(xué)家繼續(xù)努力。”張宏表示。
《中國科學(xué)報(bào)》:您對(duì)基礎(chǔ)研究堅(jiān)持面向人民生命健康有哪些體會(huì)?
張宏:基礎(chǔ)研究堅(jiān)持面向人民生命健康,需要我們從現(xiàn)實(shí)存在的疾病中尋找科學(xué)問題。多年來,我的體會(huì)是解決基礎(chǔ)科學(xué)問題和解決疾病中的科學(xué)問題二者相輔相成,不能分割。一方面,基礎(chǔ)科學(xué)問題的研究成果能夠應(yīng)用在疾病診治中,有助于應(yīng)對(duì)疾病。另一方面,從疾病中尋找并解決科學(xué)問題也能增加人類的認(rèn)知,“反哺”基礎(chǔ)科學(xué)的發(fā)展。
例如,我們以細(xì)胞自噬為視角對(duì)新冠病毒的研究,對(duì)ORF3a蛋白功能的闡明不僅有助于解釋新冠病毒逃脫自噬監(jiān)控的現(xiàn)象,也增加了我們對(duì)自噬膜動(dòng)態(tài)過程的理解。
當(dāng)然,在這個(gè)循環(huán)中,基礎(chǔ)科學(xué)的進(jìn)步是“總機(jī)關(guān)”,沒有基礎(chǔ)科學(xué)研究成果就談不上解決現(xiàn)實(shí)問題。
《中國科學(xué)報(bào)》:未來多細(xì)胞自噬的關(guān)鍵問題有哪些?
張宏:首先,自噬小體雙層膜的來源仍然不清楚,這是領(lǐng)域中最基礎(chǔ)的科學(xué)問題,將來還要進(jìn)行深入研究。第二,自噬作用的特異性如何決定,也就是說自噬如何“定點(diǎn)”清除細(xì)胞垃圾,這個(gè)問題會(huì)與健康緊密相關(guān)。第三,有關(guān)自噬活性協(xié)同調(diào)控的規(guī)律,這也是多細(xì)胞生物自噬所特有的。
總之,深入剖析多細(xì)胞生物的自噬過程, 有助于找到診斷和治療這些疾病的新靶點(diǎn),并為這類疾病的發(fā)病機(jī)制研究和臨床治療提供理論支撐。
《中國科學(xué)報(bào)》:對(duì)研究這些科學(xué)問題的新技術(shù)有什么期待?
張宏:自噬研究對(duì)探針和成像技術(shù)都提出了挑戰(zhàn)。我們知道,多細(xì)胞生物的自噬小體成熟過程要和很多囊泡進(jìn)行融合,并且過程發(fā)生很快。這就需要能夠標(biāo)記不同種類囊泡的快速探針,自噬小體、溶酶體以及內(nèi)吞體中都需要。同時(shí),對(duì)探針的靈敏度也有要求,自噬小體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)之間的互作發(fā)生在幾十納米的尺度上。我們期待這些新技術(shù)在不久的將來能夠涌現(xiàn)出來。
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