4月13日,由深圳華大生命科學(xué)研究院主導(dǎo),多國(guó)科研團(tuán)隊(duì)共同參與的首個(gè)非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物(獼猴)全身器官細(xì)胞圖譜發(fā)表于《自然》。據(jù)介紹,該圖譜將被用于物種進(jìn)化、人類疾病以及藥物評(píng)價(jià)和篩選相關(guān)的研究,有望為生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展提供基礎(chǔ)性的資源和工具,為疾病診療、靶向藥物開發(fā)提供助力,為人類更好地探究生命的進(jìn)化提供可能。
研究團(tuán)隊(duì)基于華大自主研發(fā)的單細(xì)胞建庫(kù)和測(cè)序平臺(tái)對(duì)成年獼猴的45個(gè)器官的約114萬(wàn)個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞測(cè)序分析,將其分成了113種主要的細(xì)胞類型和463種細(xì)胞亞類,并搭建了非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物百萬(wàn)單細(xì)胞交互式資源網(wǎng)站。
21世紀(jì)初,人類基因組草圖的問(wèn)世為生命科學(xué)研究譜寫了一本生命“天書”,為生命的數(shù)字化提供了基礎(chǔ)。然而,遺傳信息是由細(xì)胞攜帶的,目前,人類對(duì)自身細(xì)胞的認(rèn)識(shí)還很有限,全面解碼細(xì)胞的數(shù)字化特征將推動(dòng)生命科學(xué)的研究,為生物醫(yī)學(xué)的發(fā)展提供基礎(chǔ)性的資源和工具。為此,研究人員將目光投向了和人的基因相似度高達(dá)93%的獼猴,繪制了一張獼猴的全身器官的細(xì)胞圖譜。
“這個(gè)圖譜就像一張‘地圖’,有了它就相當(dāng)于有了一個(gè)探索生命細(xì)胞分辨率的高精度儀器,可以‘看到’每個(gè)器官都有哪些細(xì)胞,還可以精細(xì)到每個(gè)細(xì)胞里具體的分子特征及與其他細(xì)胞的互作關(guān)系。”論文的第一作者、深圳華大生命科學(xué)研究院博士韓磊介紹說(shuō),“這為我們更好地認(rèn)識(shí)生命的基本結(jié)構(gòu),探究疾病和細(xì)胞的關(guān)系打下了基礎(chǔ),也為疾病的精準(zhǔn)治療提供了新的方向。”
“非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物相比其他模式動(dòng)物,在人類疾病特別是認(rèn)知和神經(jīng)系統(tǒng)疾病研究中具有顯著優(yōu)勢(shì)。” 論文的共同通訊作者之一、深圳華大生命科學(xué)研究院劉龍奇表示,“獼猴全細(xì)胞圖譜將為人類疾病機(jī)制和臨床前研究提供豐富的信息,開拓新的視野。”
具體而言,該圖譜有助于人們?yōu)槠鞴贀p傷修復(fù)提供方向、為預(yù)防和治療病毒性傳染病及遺傳疾病提供數(shù)據(jù)支持、為縮短藥物研發(fā)時(shí)間提供助力等。
“大規(guī)模細(xì)胞圖譜的繪制工作,對(duì)于我們理解器官結(jié)構(gòu)組成、胚胎發(fā)育和衰老、人類疾病及生命演化等都具有重要的意義。未來(lái)我們還將開發(fā)更高通量的單細(xì)胞技術(shù)以及具備空間分辨率的多組學(xué)技術(shù),為全面構(gòu)建生命單細(xì)胞分辨率的時(shí)空?qǐng)D譜提供重要工具。”論文的共同通訊作者之一、深圳華大生命科學(xué)研究院院長(zhǎng)徐訊表示,“同時(shí)細(xì)胞圖譜數(shù)據(jù)正在迅速增長(zhǎng),其中蘊(yùn)含巨大的信息量,這些數(shù)據(jù)解讀和挖掘工作需要全球科學(xué)家的共同協(xié)作和努力。”
據(jù)介紹,該圖譜的繪制,離不開單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步和測(cè)序成本的下降。在過(guò)去,要繪制這樣一張“地圖“,需要大量的時(shí)間及高昂的實(shí)驗(yàn)成本。而如今,基于華大自主開發(fā)的單細(xì)胞建庫(kù)平臺(tái)(DNBelab C4)和DNBSEQ測(cè)序技術(shù),世界各地的領(lǐng)域?qū)<壹翱蒲泄ぷ髡呖梢砸缘统杀尽⒏咄?、高靈敏度和準(zhǔn)確性的方法進(jìn)行大規(guī)模的單細(xì)胞測(cè)序分析,為整個(gè)生命科學(xué)領(lǐng)域提供了一系列寶貴的數(shù)據(jù)資源。
該研究由深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合北京華大生命科學(xué)研究院、深圳國(guó)家基因庫(kù)、吉林大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院、瑞典卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院、英國(guó)劍橋大學(xué)、西班牙ICREA研究所、新加坡ASTAR等來(lái)自6個(gè)國(guó)家的35個(gè)科研團(tuán)隊(duì)共同參與完成,已通過(guò)倫理審查,嚴(yán)格遵循相應(yīng)法規(guī)和倫理準(zhǔn)則。
相關(guān)論文信息:https://www.nature.com/articles/s41586-022-04587-3
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