(資料圖片)
中新網(wǎng)成都8月15日電 (記者 賀劭清)記者15日從中科院成都生物研究所獲悉，中科院成都生物研究所植物多樣性研究團隊利用Illumina測序技術(shù)分別研究了極小種群之一的巴郎山杓蘭和對葉杓蘭的葉綠體基因組特征，并基于葉綠體基因組數(shù)據(jù)重建了蘭科植物5個亞科中的47個物種的系統(tǒng)發(fā)育樹，為闡明杓蘭屬和蘭科植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和分類關(guān)系作出了重要貢獻。
據(jù)了解，蘭科是被子植物中最大的兩個科之一，由大約880個屬和27000個種組成，占所有維管植物物種的8%。蘭科杓蘭屬植物具有獨特的彩色唇瓣，具有極高的觀賞和經(jīng)濟價值，主要分布在北半球的溫帶地區(qū)。在野外，由于自然棲息地的退化和人為過度采集，該屬的許多物種已經(jīng)變得非常稀有和極度瀕危。截至目前該屬的全部物種均被列入瀕危野生動植物國際貿(mào)易公約。
中科院成都生物研究所植物多樣性研究團隊首次報道了巴郎山杓蘭和對葉杓蘭的葉綠體基因組特征，兩個基因組長度為162,773-207,142 bp，包含128-130個基因，包括82-84個蛋白編碼基因，38個tRNA基因和8個rRNA基因；共定義了2,192個簡單序列重復(fù)(SSRs)，786個長重復(fù)序列(LSRs)和7,929個可變位點(High Variable Loci)；確定了12個高度多態(tài)的基因座(Pi>0.09)，適合于未來推斷杓蘭屬物種的系統(tǒng)發(fā)育。
此外，研究團隊還揭示了該屬葉綠體基因組顯著擴增的機制，并討論了IR區(qū)的擴增導(dǎo)致SSC區(qū)的基因假基因化或丟失。同時，基于葉綠體基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹為解決蘭科植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系提供了新的見解。
相關(guān)研究成果近期以《Comparative chloroplast genomics of seven endangered Cypripedium species and phylogenetic relationships of Orchidaceae》為題發(fā)表在《Frontiers in Plant Science》。中國科學院成都生物所和重慶師范大學聯(lián)合培養(yǎng)的碩士研究生張君議和中國科學院成都生物研究所廖敏博士為論文的共同第一作者，徐波副研究員為論文的通訊作者。相關(guān)研究得到了中國國家重點研發(fā)計劃、第二次青藏高原科學考察計劃和四川省野生植物共享與服務(wù)平臺的資助。(完)
標簽： 中科院成都生物研究所
