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中科院大連化學(xué)物理研究所提出聚集態(tài)蛋白質(zhì)相互作用組的交聯(lián)解析新方法


(相關(guān)資料圖)

近日,我所蛋白質(zhì)折疊化學(xué)生物學(xué)創(chuàng)新特區(qū)研究組(02T5組)劉宇研究員團(tuán)隊、生物分子高效分離與表征研究組(1810組)張麗華研究員團(tuán)隊,以及西湖大學(xué)張鑫教授團(tuán)隊等合作,通過系統(tǒng)性調(diào)控綠色熒光蛋白發(fā)色團(tuán)的骨架結(jié)構(gòu),實現(xiàn)分子的三重態(tài)化學(xué)活性,并用于活細(xì)胞內(nèi)聚集態(tài)蛋白質(zhì)的靶向交聯(lián),獲得了聚集態(tài)蛋白質(zhì)的相互作用信息。

蛋白質(zhì)的錯誤折疊、變性與聚集會引發(fā)多種蛋白質(zhì)構(gòu)型疾病,如阿爾茲海默癥、帕金森癥、漸凍人癥和淀粉樣心肌病等。目前,聚集態(tài)蛋白的研究主要停留在發(fā)展熒光探針觀察其位置形貌并示蹤聚集過程,用于疾病的早期發(fā)現(xiàn)和臨床診斷。然而,用于解析細(xì)胞內(nèi)聚集態(tài)的蛋白質(zhì)組成成分和相互作用信息的分析工具鮮有報道。聚集態(tài)蛋白質(zhì)的組分和互作信息對于揭示上述疾病的發(fā)病機制,尋找新的診療靶點具有積極的科學(xué)和臨床意義。

近年來,劉宇團(tuán)隊針對細(xì)胞內(nèi)聚集態(tài)蛋白質(zhì)缺乏完整三維結(jié)構(gòu)信息、難以實現(xiàn)靶向探測這一領(lǐng)域難點,提出靶向聚集態(tài)蛋白質(zhì)內(nèi)部孔道特征微環(huán)境的探針設(shè)計思路(Angew. Chem. Int. Ed.,2021;Angew. Chem. Int. Ed.,2021),實現(xiàn)了胞內(nèi)致病聚集態(tài)蛋白的位置形貌分析(Anal. Chem.,2021)、共聚集過程的機制解析(Chem. Sci.,2021)和內(nèi)部微環(huán)境異質(zhì)性的定量分析(Angew. Chem. Int. Ed.,2021;ACS Sens.,2022)。然而,上述工作僅局限于蛋白質(zhì)聚集過程的動態(tài)觀測,缺乏對其組成成分和相互作用的進(jìn)一步剖析。

本工作中,劉宇團(tuán)隊與張麗華團(tuán)隊合作,通過衍生天然熒光蛋白的發(fā)色基團(tuán),實現(xiàn)其三重態(tài)光交聯(lián)性質(zhì)的理性調(diào)控,并利用該分子骨架結(jié)構(gòu)對聚集態(tài)蛋白質(zhì)的胞內(nèi)靶向結(jié)合,實現(xiàn)對聚集態(tài)蛋白的組分和互作信息的規(guī)?;馕?。此外,劉宇團(tuán)隊和張鑫團(tuán)隊利用綠色熒光蛋白發(fā)色團(tuán)骨架(HBI),進(jìn)行分子結(jié)構(gòu)衍生并實現(xiàn)了規(guī)律性調(diào)控分子產(chǎn)生活性氧的效率,為蛋白質(zhì)的化學(xué)鄰近標(biāo)記奠定基礎(chǔ)。針對標(biāo)記蛋白的高度復(fù)雜性、難鑒定的挑戰(zhàn),張麗華團(tuán)隊通過發(fā)展高精準(zhǔn)、高通量的蛋白質(zhì)相互作用解析技術(shù),對光氧化和光交聯(lián)聚集態(tài)蛋白質(zhì)光反應(yīng)類型和修飾位點進(jìn)行了高靈敏度鑒定,進(jìn)而實現(xiàn)了聚集態(tài)蛋白質(zhì)的組分和互作信息的高可信度確認(rèn)。同時,我所吳凱豐研究員團(tuán)隊和華盛頓大學(xué)李曉松教授團(tuán)隊通過分子激發(fā)態(tài)測量和理論計算,探討了該類分子三重態(tài)化學(xué)的機制,為本工作的光氧化和光交聯(lián)提供了理論支撐。作為一類仿生新型的光敏劑和光交聯(lián)劑,該工作也展示了其在發(fā)色團(tuán)輔助光失活(CALI),光動力治療(PDT),以及有機光聚合反應(yīng)等場景的應(yīng)用潛力。

上述成果以“Enabling Photo-Crosslinking and Photo-Sensitizing Properties for Synthetic Fluorescent Protein Chromophores”為題,于近日發(fā)表在《德國應(yīng)用化學(xué)》(Angew. Chem. Int. Ed.)上。該工作的第一作者是我所02T5組博士研究生馮煥和1810組趙群研究員。該工作得到了國家自然科學(xué)基金、國家重點研發(fā)計劃、中科院青促會、美國國家科學(xué)基金等項目的資助。(文/圖 馮煥、趙群)

文章鏈接:https://doi.org/10.1002/anie.202215215

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