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抗病基因“假扮”激素受體“誘敵深入”

2022-12-15 09:05:03
中國科學報 發(fā)布時間:2022/12/15 6:48:35
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抗病基因“假扮”激素受體“誘敵深入”

 

7年前的一個周六晚上,南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院教授陶小榮照例和學生們交流研究進展。學生陳靜剛剛做出來的辣椒免疫受體Tsw的電泳圖結(jié)果引起了他的注意。

“這個受體是同類型其它受體的兩倍大小。為什么它會這么大?它到底有什么功能?” 陶小榮覺得,這個看似偶然的現(xiàn)象很可能是揭秘植物抗病機制的重要線索。“只有做重要的科學問題,才能出重大的突破。”

此后,他們在這片“無人區(qū)”堅持不懈的探索,并第一次揭示了病原物效應(yīng)子直接靶向植物激素受體促進侵染,而植物NLR免疫受體模擬受攻擊的激素受體監(jiān)控病毒效應(yīng)子的干擾,并激活免疫機制的新機制。

12月15日,這一研究成果在線發(fā)表于《自然》雜志。中國工程院院士康振生說,這一新的進展,為我國植物免疫學研究揭開了新的一頁,提供了新的思路;為抗病育種等應(yīng)用前景奠定了必不可少的理論基礎(chǔ)和技術(shù)途徑。

一張電泳圖引發(fā)的研究

電泳圖結(jié)果中,辣椒免疫受體基因Tsw的大小是6.3kb。而一些經(jīng)典的NLR免疫受體基因只有3kb。能敏銳地觀察到這個“異常”,是由于這個團隊已經(jīng)深耕植物免疫系統(tǒng)研究多年。

陶小榮告訴《中國科學報》,當時他們正在研究番茄斑萎病毒,該病毒是最具破壞性的植物病毒之一,每年在全球范圍內(nèi)對辣椒、番茄等重要經(jīng)濟作物造成了嚴重的經(jīng)濟損失。

番茄感染番茄斑萎病毒后癥狀。南京農(nóng)大供圖

辣椒感染番茄斑萎病毒后癥狀。南京農(nóng)大供圖

然而,經(jīng)歷了千萬年的進化,病原微生物和植物之間一直在進行著復雜而精細的進攻與防御的“軍備競賽”。想要在這場紛亂的“戰(zhàn)爭”中厘清機制,并不是一件容易的事。

陶小榮解釋說,病原微生物為了自己的侵染和傳播,需要入侵到植物體內(nèi),它利用自己的“武器”去攻擊寄主植物;而植物為了自身的生存,需要跟病原物去戰(zhàn)斗,從而進化出防御系統(tǒng)監(jiān)控并銷毀病原物“武器”的攻擊。

“在彼此戰(zhàn)斗過程中,病原物的‘武器’會越來越多樣化,而植物也會進化出越來越多樣化的防御系統(tǒng),阻止病原物的進攻,這就是植物和病原之間的‘軍備競賽’。”陶小榮說,植物和病原之間的軍備競賽機制是一個復制而精密的系統(tǒng),搞清楚里面的一條條線索和機制,需要大膽地假設(shè)和小心地求證。

“找到重要的線索,這個就是做科研的奧秘所在。”陶小榮說,已知Tsw是辣椒中針對番茄斑萎病毒的抗病基因,它編碼一個NLR免疫受體,通過識別病毒編碼的效應(yīng)子NSs蛋白進而誘導植物對病毒的免疫反應(yīng)。這正是論文共同第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院博士生陳靜能夠在對Tsw的研究中發(fā)現(xiàn)重要線索的原因。

陳靜介紹,然而Tsw-NLR受體蛋白的一級結(jié)構(gòu)上比對不到什么有用的信息,此前也沒有其他相關(guān)研究可以參考,無法解析Tsw這么大的功能是什么。因此他們就開始分析該蛋白的三維結(jié)構(gòu)模型,希望找到有用的線索。

“這是一個知識盲區(qū),用現(xiàn)有的知識體系還無法解釋這樣的現(xiàn)象。前沿研究是無人區(qū)。”陶小榮說,這個課題經(jīng)歷過一波三折,克服一道道困難,沒有堅持是不可能完成的。

“模擬”激素受體 “誘騙”病毒效應(yīng)子

通過三維結(jié)構(gòu)建模和同源比對分析發(fā)現(xiàn),在Tsw中具有一個超大的富含亮氨酸重復序列結(jié)構(gòu)域(LRR)。更令人吃驚的是,該結(jié)構(gòu)域竟然與植物激素茉莉酸、生長素和獨腳金內(nèi)酯這三個植物激素的受體相似。

在植物復雜而精細的免疫系統(tǒng)中,由激素激發(fā)的免疫途徑在抗病過程中發(fā)揮重要作用。陶小榮介紹,茉莉酸參與抗病和抗蟲,這都是過去眾所周知的。生長素參與植物的生長,比如向光性,但也參與對病毒的抗性。獨腳金內(nèi)酯參與植物分蘗,也曾被報道可以抗病和抗線蟲。

在激素通路中,激素受體感受到激素后,會啟動下游一系列的基因進行轉(zhuǎn)錄重編程。茉莉酸受體COI1、生長素受體TIR1和獨腳金內(nèi)酯受體搭檔蛋白MAX2都帶有一個LRR結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域起著啟動激素通路的作用。而Tsw-NLR受體蛋白中的LRR結(jié)構(gòu)域正是與激素受體的LRR結(jié)構(gòu)域相似。

“這直接促使我們提出一個‘軍備競賽’的假說:病毒會攻擊這三種植物激素的受體,而Tsw這個NLR免疫受體是用來監(jiān)控病毒的這種攻擊的。這是這個課題最重要的科學問題。”陶小榮說。

Tsw NLR免疫受體監(jiān)控病毒靶向激素受體誘導抗病的工作機制圖。南京農(nóng)大供圖

過去研究中有不少病原物效應(yīng)子攻擊植物激素通路的報道,但是沒有報道過病原物效應(yīng)子直接攻擊植物激素受體的例子,植物免疫系統(tǒng)是否能夠監(jiān)控效應(yīng)子也不知道。

不過,科學家已經(jīng)知道,Tsw通過識別病毒效應(yīng)子NSs,誘導植物產(chǎn)生強烈的抗病反應(yīng)。“于是我們想到,病毒NSs蛋白會攻擊這三種植物激素的受體,而Tsw這個免疫受體則進化出類似于植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,通過模擬植物激素受體,‘誘騙’病毒效應(yīng)子NSs,繼而監(jiān)視病原物攻擊過程,最終通過植物免疫系統(tǒng)實現(xiàn)抗病這一過程。”陶小榮說。

“魔”高一尺“道”高一丈

進一步的研究證實了這個猜測。病毒效應(yīng)子NSs與三種植物激素通路互作時,并不直接與激素受體相互作用,而是與一種名為TCP21的蛋白質(zhì)直接相結(jié)合,TCP21能夠與三種激素受體相互作用并抑制激素信號的活性。

陶小榮解釋,當TCP21與病毒效應(yīng)子一結(jié)合,就好像形成了一條遏制激素活性的繩索,將激素受體牢牢捆綁在一起,束縛了它們的手腳,活力自然大大降低。這樣一來,由激素系統(tǒng)激發(fā)的免疫通路就陷入了癱瘓。

激素介導的這一層免疫系統(tǒng)淪陷,植物另一層免疫系統(tǒng)卻在暗中儲備“兵力”。論文共同第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學植物學院博士生趙延曉介紹,植物免疫受體Tsw進化出來模擬植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,也與TCP21結(jié)合,并巧妙利用了病毒蛋白“捆大繩”的特性,在病毒蛋白NSs存在下,Tsw—NLR免疫受體與TCP21的結(jié)合,相對于激素受體與TCP21的結(jié)合具有更強的親和力。

因此,病毒靶向激素受體的時候,NLR免疫受體Tsw會率先感知到這個過程,進而迅速觸發(fā)免疫反應(yīng)。

“TCP21同時跟三個激素受體互作,病毒效應(yīng)子NSs通過靶向TCP21把三種激素受體全部‘干掉’,這是病毒的‘高明’之處。而植物免疫受體Tsw—NLR進化出來模擬植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,也與TCP21互作,病毒效應(yīng)子NSs靶向三個激素的時候,免疫受體Tsw—NLR憑借更強的結(jié)合力會提前感知到這個過程,并與病毒效應(yīng)子NSs結(jié)合,激發(fā)下游免疫反應(yīng)。這是植物免疫受體的‘高明’之處。”陶小榮說。

而且,激素介導的抗病是一種比較弱的基礎(chǔ)抗病性。NLR免疫受體蛋白介導的抗病性則非常強烈持久,可以有效滅除病原菌。在病毒效應(yīng)子NSs存在的情況下,植物通過這一機制“選擇”了更為強烈的NLR免疫反應(yīng),誘敵深入,從而更好的保護自己。“這為作物抗病的生產(chǎn)應(yīng)用提供了廣闊前景。”陶小榮說。

新機制為抗病育種提供新思路

陶小榮強調(diào),沒有病原菌時,NLR免疫受體這個“開關(guān)”處于關(guān)閉狀態(tài),這時抗性不啟動;當病原菌入侵時,NLR免疫受體感知到效應(yīng)子,開關(guān)就會打開,轉(zhuǎn)換成另外一種狀態(tài),啟動下游一系列抗病反應(yīng)。

陶小榮(左)帶領(lǐng)學生分析實驗現(xiàn)象。南京農(nóng)大供圖

他說,NLR免疫受體也是過去人們所熟知的經(jīng)典的抗病基因(R基因),是在生產(chǎn)上最有利用價值的抗病基因。這一類的抗病基因的特點是,單基因就可以具有免疫作用,只要將這個抗病基因通過雜交和回交引導感病品種中,感病品種就可以實現(xiàn)抗病性。因此這一類抗病基因在抗病育種中得到廣泛應(yīng)用。

“全球每年因病毒病造成的作物經(jīng)濟損失超過4000億元。雖然沒有有效殺滅病毒病的農(nóng)藥,但是利用抗病品種可以將其有效控制。”陶小榮說。

《自然》審稿專家表示,這一研究結(jié)果提供了一個復雜的“效應(yīng)子毒性—NLR反毒性”的令人感到神奇的案例。這一發(fā)現(xiàn)非常精彩,將對植物免疫學相關(guān)領(lǐng)域產(chǎn)生深遠的影響。

中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所研究員周儉民說,病毒是病原微生物中最小最簡單的一種,但是人類至今對病毒了解的不多。該研究成果深入研究了抗病毒基因,揭示了前所未知的新的抗病機制,將啟發(fā)科學家如何影響植物的激素系統(tǒng),使得植物能夠更好的抵抗形形色色的病毒病害。

康振生建議,進一步的研究可以聚焦在如何把新發(fā)現(xiàn)的抗病機理與生物育種有機結(jié)合起來之上,并為其它作物和病毒病研究提供借鑒和參考。對抗病機制的進一步探索和研究,可以在這些新的知識和理論體系的指導下,發(fā)展出新的抗病技術(shù)、培育出新的抗病材料。

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-022-05529-9

 
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7年前的一個周六晚上,南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院教授陶小榮照例和學生們交流研究進展。學生陳靜剛剛做出來的辣椒免疫受體Tsw的電泳圖結(jié)果引起了他的注意。

“這個受體是同類型其它受體的兩倍大小。為什么它會這么大?它到底有什么功能?” 陶小榮覺得,這個看似偶然的現(xiàn)象很可能是揭秘植物抗病機制的重要線索。“只有做重要的科學問題,才能出重大的突破。”


(資料圖片僅供參考)

此后,他們在這片“無人區(qū)”堅持不懈的探索,并第一次揭示了病原物效應(yīng)子直接靶向植物激素受體促進侵染,而植物NLR免疫受體模擬受攻擊的激素受體監(jiān)控病毒效應(yīng)子的干擾,并激活免疫機制的新機制。

12月15日,這一研究成果在線發(fā)表于《自然》雜志。中國工程院院士康振生說,這一新的進展,為我國植物免疫學研究揭開了新的一頁,提供了新的思路;為抗病育種等應(yīng)用前景奠定了必不可少的理論基礎(chǔ)和技術(shù)途徑。

一張電泳圖引發(fā)的研究

電泳圖結(jié)果中,辣椒免疫受體基因Tsw的大小是6.3kb。而一些經(jīng)典的NLR免疫受體基因只有3kb。能敏銳地觀察到這個“異常”,是由于這個團隊已經(jīng)深耕植物免疫系統(tǒng)研究多年。

陶小榮告訴《中國科學報》,當時他們正在研究番茄斑萎病毒,該病毒是最具破壞性的植物病毒之一,每年在全球范圍內(nèi)對辣椒、番茄等重要經(jīng)濟作物造成了嚴重的經(jīng)濟損失。

番茄感染番茄斑萎病毒后癥狀。南京農(nóng)大供圖

辣椒感染番茄斑萎病毒后癥狀。南京農(nóng)大供圖

然而,經(jīng)歷了千萬年的進化,病原微生物和植物之間一直在進行著復雜而精細的進攻與防御的“軍備競賽”。想要在這場紛亂的“戰(zhàn)爭”中厘清機制,并不是一件容易的事。

陶小榮解釋說,病原微生物為了自己的侵染和傳播,需要入侵到植物體內(nèi),它利用自己的“武器”去攻擊寄主植物;而植物為了自身的生存,需要跟病原物去戰(zhàn)斗,從而進化出防御系統(tǒng)監(jiān)控并銷毀病原物“武器”的攻擊。

“在彼此戰(zhàn)斗過程中,病原物的‘武器’會越來越多樣化,而植物也會進化出越來越多樣化的防御系統(tǒng),阻止病原物的進攻,這就是植物和病原之間的‘軍備競賽’。”陶小榮說,植物和病原之間的軍備競賽機制是一個復制而精密的系統(tǒng),搞清楚里面的一條條線索和機制,需要大膽地假設(shè)和小心地求證。

“找到重要的線索,這個就是做科研的奧秘所在。”陶小榮說,已知Tsw是辣椒中針對番茄斑萎病毒的抗病基因,它編碼一個NLR免疫受體,通過識別病毒編碼的效應(yīng)子NSs蛋白進而誘導植物對病毒的免疫反應(yīng)。這正是論文共同第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院博士生陳靜能夠在對Tsw的研究中發(fā)現(xiàn)重要線索的原因。

陳靜介紹,然而Tsw-NLR受體蛋白的一級結(jié)構(gòu)上比對不到什么有用的信息,此前也沒有其他相關(guān)研究可以參考,無法解析Tsw這么大的功能是什么。因此他們就開始分析該蛋白的三維結(jié)構(gòu)模型,希望找到有用的線索。

“這是一個知識盲區(qū),用現(xiàn)有的知識體系還無法解釋這樣的現(xiàn)象。前沿研究是無人區(qū)。”陶小榮說,這個課題經(jīng)歷過一波三折,克服一道道困難,沒有堅持是不可能完成的。

“模擬”激素受體 “誘騙”病毒效應(yīng)子

通過三維結(jié)構(gòu)建模和同源比對分析發(fā)現(xiàn),在Tsw中具有一個超大的富含亮氨酸重復序列結(jié)構(gòu)域(LRR)。更令人吃驚的是,該結(jié)構(gòu)域竟然與植物激素茉莉酸、生長素和獨腳金內(nèi)酯這三個植物激素的受體相似。

在植物復雜而精細的免疫系統(tǒng)中,由激素激發(fā)的免疫途徑在抗病過程中發(fā)揮重要作用。陶小榮介紹,茉莉酸參與抗病和抗蟲,這都是過去眾所周知的。生長素參與植物的生長,比如向光性,但也參與對病毒的抗性。獨腳金內(nèi)酯參與植物分蘗,也曾被報道可以抗病和抗線蟲。

在激素通路中,激素受體感受到激素后,會啟動下游一系列的基因進行轉(zhuǎn)錄重編程。茉莉酸受體COI1、生長素受體TIR1和獨腳金內(nèi)酯受體搭檔蛋白MAX2都帶有一個LRR結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域起著啟動激素通路的作用。而Tsw-NLR受體蛋白中的LRR結(jié)構(gòu)域正是與激素受體的LRR結(jié)構(gòu)域相似。

“這直接促使我們提出一個‘軍備競賽’的假說:病毒會攻擊這三種植物激素的受體,而Tsw這個NLR免疫受體是用來監(jiān)控病毒的這種攻擊的。這是這個課題最重要的科學問題。”陶小榮說。

Tsw NLR免疫受體監(jiān)控病毒靶向激素受體誘導抗病的工作機制圖。南京農(nóng)大供圖

過去研究中有不少病原物效應(yīng)子攻擊植物激素通路的報道,但是沒有報道過病原物效應(yīng)子直接攻擊植物激素受體的例子,植物免疫系統(tǒng)是否能夠監(jiān)控效應(yīng)子也不知道。

不過,科學家已經(jīng)知道,Tsw通過識別病毒效應(yīng)子NSs,誘導植物產(chǎn)生強烈的抗病反應(yīng)。“于是我們想到,病毒NSs蛋白會攻擊這三種植物激素的受體,而Tsw這個免疫受體則進化出類似于植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,通過模擬植物激素受體,‘誘騙’病毒效應(yīng)子NSs,繼而監(jiān)視病原物攻擊過程,最終通過植物免疫系統(tǒng)實現(xiàn)抗病這一過程。”陶小榮說。

“魔”高一尺“道”高一丈

進一步的研究證實了這個猜測。病毒效應(yīng)子NSs與三種植物激素通路互作時,并不直接與激素受體相互作用,而是與一種名為TCP21的蛋白質(zhì)直接相結(jié)合,TCP21能夠與三種激素受體相互作用并抑制激素信號的活性。

陶小榮解釋,當TCP21與病毒效應(yīng)子一結(jié)合,就好像形成了一條遏制激素活性的繩索,將激素受體牢牢捆綁在一起,束縛了它們的手腳,活力自然大大降低。這樣一來,由激素系統(tǒng)激發(fā)的免疫通路就陷入了癱瘓。

激素介導的這一層免疫系統(tǒng)淪陷,植物另一層免疫系統(tǒng)卻在暗中儲備“兵力”。論文共同第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學植物學院博士生趙延曉介紹,植物免疫受體Tsw進化出來模擬植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,也與TCP21結(jié)合,并巧妙利用了病毒蛋白“捆大繩”的特性,在病毒蛋白NSs存在下,Tsw—NLR免疫受體與TCP21的結(jié)合,相對于激素受體與TCP21的結(jié)合具有更強的親和力。

因此,病毒靶向激素受體的時候,NLR免疫受體Tsw會率先感知到這個過程,進而迅速觸發(fā)免疫反應(yīng)。

“TCP21同時跟三個激素受體互作,病毒效應(yīng)子NSs通過靶向TCP21把三種激素受體全部‘干掉’,這是病毒的‘高明’之處。而植物免疫受體Tsw—NLR進化出來模擬植物激素受體的結(jié)構(gòu)域,也與TCP21互作,病毒效應(yīng)子NSs靶向三個激素的時候,免疫受體Tsw—NLR憑借更強的結(jié)合力會提前感知到這個過程,并與病毒效應(yīng)子NSs結(jié)合,激發(fā)下游免疫反應(yīng)。這是植物免疫受體的‘高明’之處。”陶小榮說。

而且,激素介導的抗病是一種比較弱的基礎(chǔ)抗病性。NLR免疫受體蛋白介導的抗病性則非常強烈持久,可以有效滅除病原菌。在病毒效應(yīng)子NSs存在的情況下,植物通過這一機制“選擇”了更為強烈的NLR免疫反應(yīng),誘敵深入,從而更好的保護自己。“這為作物抗病的生產(chǎn)應(yīng)用提供了廣闊前景。”陶小榮說。

新機制為抗病育種提供新思路

陶小榮強調(diào),沒有病原菌時,NLR免疫受體這個“開關(guān)”處于關(guān)閉狀態(tài),這時抗性不啟動;當病原菌入侵時,NLR免疫受體感知到效應(yīng)子,開關(guān)就會打開,轉(zhuǎn)換成另外一種狀態(tài),啟動下游一系列抗病反應(yīng)。

陶小榮(左)帶領(lǐng)學生分析實驗現(xiàn)象。南京農(nóng)大供圖

他說,NLR免疫受體也是過去人們所熟知的經(jīng)典的抗病基因(R基因),是在生產(chǎn)上最有利用價值的抗病基因。這一類的抗病基因的特點是,單基因就可以具有免疫作用,只要將這個抗病基因通過雜交和回交引導感病品種中,感病品種就可以實現(xiàn)抗病性。因此這一類抗病基因在抗病育種中得到廣泛應(yīng)用。

“全球每年因病毒病造成的作物經(jīng)濟損失超過4000億元。雖然沒有有效殺滅病毒病的農(nóng)藥,但是利用抗病品種可以將其有效控制。”陶小榮說。

《自然》審稿專家表示,這一研究結(jié)果提供了一個復雜的“效應(yīng)子毒性—NLR反毒性”的令人感到神奇的案例。這一發(fā)現(xiàn)非常精彩,將對植物免疫學相關(guān)領(lǐng)域產(chǎn)生深遠的影響。

中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所研究員周儉民說,病毒是病原微生物中最小最簡單的一種,但是人類至今對病毒了解的不多。該研究成果深入研究了抗病毒基因,揭示了前所未知的新的抗病機制,將啟發(fā)科學家如何影響植物的激素系統(tǒng),使得植物能夠更好的抵抗形形色色的病毒病害。

康振生建議,進一步的研究可以聚焦在如何把新發(fā)現(xiàn)的抗病機理與生物育種有機結(jié)合起來之上,并為其它作物和病毒病研究提供借鑒和參考。對抗病機制的進一步探索和研究,可以在這些新的知識和理論體系的指導下,發(fā)展出新的抗病技術(shù)、培育出新的抗病材料。

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-022-05529-9

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