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天天熱點(diǎn)!華中農(nóng)大建成全球首個(gè)水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù)

2023-04-10 16:55:17
央視新聞客戶端 發(fā)布時(shí)間:2023/4/10 16:59:51
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華中農(nóng)大建成全球首個(gè)水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù)

 

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、湖北洪山實(shí)驗(yàn)室張建偉教授課題組近日發(fā)表最新研究成果,他們建成世界上首個(gè)基于同源基因的水稻泛基因組綜合數(shù)據(jù)庫(kù)——水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù)。

據(jù)介紹,這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)如同一本近義詞詞典。在數(shù)據(jù)庫(kù)里,亞洲稻的每一個(gè)基因都能輕松找到同源或相近的基因,以及追蹤其演變歷史。目前,數(shù)據(jù)庫(kù)儲(chǔ)存于華中農(nóng)業(yè)大學(xué),向全球開放免費(fèi)使用。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食。據(jù)記載,全球共有多達(dá)78萬(wàn)份水稻種質(zhì)材料,其中國(guó)際水稻研究所種質(zhì)資源庫(kù)里收藏的亞洲稻種質(zhì)及其野生近緣種就達(dá)13萬(wàn)多份。張建偉教授課題組所建成的水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù),是從13萬(wàn)多份亞洲稻種質(zhì)中選取具有遺傳多樣性代表的3000份核心種植資源,再?gòu)?000份中選取最具代表性的16份,完成全基因組測(cè)序及基因注釋,作為其基本數(shù)據(jù)信息。

(總臺(tái)記者 許偉 彭照)

 
 
 
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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、湖北洪山實(shí)驗(yàn)室張建偉教授課題組近日發(fā)表最新研究成果,他們建成世界上首個(gè)基于同源基因的水稻泛基因組綜合數(shù)據(jù)庫(kù)——水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù)。

據(jù)介紹,這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)如同一本近義詞詞典。在數(shù)據(jù)庫(kù)里,亞洲稻的每一個(gè)基因都能輕松找到同源或相近的基因,以及追蹤其演變歷史。目前,數(shù)據(jù)庫(kù)儲(chǔ)存于華中農(nóng)業(yè)大學(xué),向全球開放免費(fèi)使用。

亞洲栽培稻是世界一半人口的主食。據(jù)記載,全球共有多達(dá)78萬(wàn)份水稻種質(zhì)材料,其中國(guó)際水稻研究所種質(zhì)資源庫(kù)里收藏的亞洲稻種質(zhì)及其野生近緣種就達(dá)13萬(wàn)多份。張建偉教授課題組所建成的水稻基因索引數(shù)據(jù)庫(kù),是從13萬(wàn)多份亞洲稻種質(zhì)中選取具有遺傳多樣性代表的3000份核心種植資源,再?gòu)?000份中選取最具代表性的16份,完成全基因組測(cè)序及基因注釋,作為其基本數(shù)據(jù)信息。

(總臺(tái)記者 許偉 彭照)

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