在論文共同第一作者葛蔚然的講述中,這項(xiàng)研究逐漸生動(dòng)起來:“大家都知道DNA是生物遺傳信息的載體,但你知道它們在真核細(xì)胞中是怎么存在的嗎?”
“這是一個(gè)非常有意義的發(fā)現(xiàn)。”朱冰向《中國科學(xué)報(bào)》解釋,“大多數(shù)染色質(zhì)修飾酶的特異性,是通過局部的特異性‘催化口袋’實(shí)現(xiàn)的。而這個(gè)酶,是已知唯一一個(gè)通過大范圍的結(jié)構(gòu)取向來獲得特異性的。打個(gè)比方,它靠的不是口袋本身的結(jié)構(gòu)有特異性,而是直接把口袋轉(zhuǎn)了個(gè)方向,只和開口方向的底物結(jié)合?!?/section>“如果未來發(fā)現(xiàn),它不是‘唯一一個(gè)’,而是‘第一個(gè)’,那就更有趣了。那將大大拓展我們對酶特異性的認(rèn)識?!敝毂a(bǔ)充道,“我想這才是《自然》接受這項(xiàng)工作的原因?!?/p>
3位“95后”的接力時(shí)速
這篇論文的3位共同一作都是“95后”,其中兩人出生于1995年,一人出生于1997年。3個(gè)年輕人在這項(xiàng)工作中都經(jīng)歷了許多挑戰(zhàn),也收獲了巨大的成長。
今年26歲的葛蔚然,看起來比實(shí)際年齡還要小一些。8年前,她以691分的高考成績成為中國科學(xué)院大學(xué)(國科大)第二批本科生。在以“科教融合”為特色的國科大,本科生就可以選擇一位科學(xué)家作為自己的學(xué)業(yè)導(dǎo)師,就這樣,葛蔚然來到了生物物理研究所研究員許瑞明門下。?大四這年,許老師給她兩個(gè)課題來選擇。第一個(gè)課題比較簡單,第二個(gè)課題則是“傳說中的難題”——此前有一位師姐直到畢業(yè)也沒能做出來。沒有太多猶豫,葛蔚然選擇了更有挑戰(zhàn)性的那個(gè)。但即便是“學(xué)霸”,剛開始做實(shí)驗(yàn)時(shí)也頻頻受挫,“十有八九都是失敗的結(jié)果”。在不斷重復(fù)和試錯(cuò)的過程中,她漸漸錘煉出更加積極平和的心態(tài),對知識和技術(shù)的把握也越來越純熟了。28歲的余聰是葛蔚然的同門師兄,主要負(fù)責(zé)這項(xiàng)工作中有關(guān)冷凍電鏡的部分。在為PR-DUB與核小體復(fù)合物樣品“拍照”這一步上,他足足困了3年。因?yàn)槊赴l(fā)揮作用的速度非??欤麄€(gè)過程轉(zhuǎn)瞬即逝,很難用冷凍電鏡拍清楚?!熬拖衽囊粋€(gè)迅速搖頭的人。他的身體和四肢都很清楚,唯獨(dú)最重要的腦袋看不清楚?!彼Φ馈?/section>后來,他們想出一套巧妙的辦法:引入單點(diǎn)突變來降低酶的活性,讓酶的動(dòng)態(tài)變成“慢動(dòng)作”。同時(shí)運(yùn)用蛋白質(zhì)交聯(lián)等技術(shù),不松不緊剛剛好地把酶的“腦袋”固定住。終于拍出了清晰的照片。這個(gè)難點(diǎn)突破后,后續(xù)的研究工作就順利了很多。此時(shí),本文的第三位共同一作,朱冰課題組的李晶晶加入了這項(xiàng)工作。她主要負(fù)責(zé)在細(xì)胞內(nèi)驗(yàn)證上述結(jié)構(gòu)和功能的精巧關(guān)系。這部分工作在技術(shù)上不是特別困難,但她需要與時(shí)間賽跑。特別是第二次審稿后補(bǔ)充實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,《自然》編輯只給了他們一個(gè)月時(shí)間。但細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的固有周期是無法縮短的,一個(gè)月的時(shí)間肯定不夠用。在許瑞明和朱冰兩位老師的爭取下,他們又得到了兩周的寬限時(shí)間。但編輯同時(shí)也告訴他們,如果這兩周內(nèi)有其他團(tuán)隊(duì)的類似工作發(fā)表了,就會(huì)把這篇論文拒稿。當(dāng)時(shí)恰巧是2022年底北京疫情非常嚴(yán)峻的時(shí)期,為了避免出師未捷人先“陽”,李晶晶把行李帶到實(shí)驗(yàn)室,像游擊隊(duì)員般完成了后續(xù)所有實(shí)驗(yàn)。?在所有人的努力下,這篇論文終于成功被《自然》雜志接收。而論文接收幾天后,預(yù)印本網(wǎng)站上就出現(xiàn)了一項(xiàng)紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院科學(xué)家發(fā)表的類似工作。他們跑贏了。
捅破窗戶紙,才能做更好的科研
大約5、6年前,類似這樣解析核小體和染色質(zhì)修飾酶結(jié)構(gòu)的論文多數(shù)都能發(fā)表在頂級學(xué)術(shù)期刊上。但現(xiàn)在,這可一點(diǎn)也不容易了。
“原因很簡單,結(jié)構(gòu)生物學(xué)的技術(shù)一直在發(fā)展,解析這些結(jié)構(gòu)變得越來越簡單。”朱冰說,“這迫使結(jié)構(gòu)生物學(xué)家們重新審視,什么才是更重要的科學(xué)問題,什么才是更好的科學(xué)研究?!?/section>第一次投稿到《科學(xué)》雜志上的稿件,對文中真正重要和閃光的部分,只是模模糊糊地提到,但沒有把窗戶紙捅破。而經(jīng)過修改后的稿件,把他們發(fā)現(xiàn)的新奇現(xiàn)象,提升到了一個(gè)足夠的理論高度。朱冰早年曾在中國科學(xué)院上海植物生理研究所攻讀博士學(xué)位,當(dāng)時(shí)中國科學(xué)院院士沈善炯的一個(gè)特點(diǎn)給他留下了深刻印象:“沈先生非常擅于總結(jié),擅于把現(xiàn)象提升到理論水平。同樣的一件事,讓他來講,就能講到人們心里?!?/section>“這種思想上、認(rèn)識上的高度,不僅能讓科學(xué)家更好地總結(jié)自己做過的工作,也有助于提升科學(xué)家的品味,讓他們前瞻性地選擇更有價(jià)值、更有高度的工作。”朱冰說。https://www.nature.com/articles/s41586-023-05841-y
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