美國洛克菲勒大學(xué)Jeremy M. Rock和威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院Dirk Schnappinger小組合作利用全基因組基因表達(dá)調(diào)控揭示了結(jié)核分枝桿菌 (Mtb)的脆弱性。該項(xiàng)研究成果近日在線發(fā)表于《細(xì)胞》。
研究人員開發(fā)了一種基于CRISPR干擾的功能基因組學(xué)方法,以系統(tǒng)地確定結(jié)核分枝桿菌中的基因表達(dá)并監(jiān)測細(xì)菌的適應(yīng)性。研究在各種過程中確定了具有高度脆弱性的基因,包括未知的藥物新靶點(diǎn)。同時(shí),研究確定了必需的基本基因,這可能解釋了藥物研發(fā)失敗的原因。正常和高毒力Mtb分離株之間的脆弱性比較揭示了脆弱性的不完全保護(hù),并且不同的脆弱性可以預(yù)測不同的抗菌敏感性。該研究結(jié)果定量定義了基本的細(xì)菌過程,并發(fā)現(xiàn)了具有藥物開發(fā)潛能的新靶點(diǎn)。
據(jù)介紹,抗菌藥物靶向必需基因,但很少能實(shí)現(xiàn)完全抑菌的目的。因此,利用傳統(tǒng)遺傳方法得到的對(duì)必需基因有或無效的靶點(diǎn)并非是最有吸引力的細(xì)菌靶標(biāo),因?yàn)橐种谱饔貌蛔惴炊鴮?dǎo)致細(xì)菌適應(yīng)性增加。相比之下,基因“脆弱性”是一種連續(xù)的、可量化的特征,它把基因的抑制程度與對(duì)細(xì)菌適應(yīng)性的影響聯(lián)系起來。